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动作的激活可能有两种情况：一是外源性线索激活，二是内源性线索激活。外源性线索更多依靠外部的刺激进行运动反应（如根据看到的障碍物而作出避让的动作，或者是根据记忆中的障碍物位置作出避让），而外源性线索的运动更多与运动前区有关（运动前区广泛地受到顶叶和小脑的神经支配）。内源性线索指自我引导的、习得较好的运动，往往和辅助运动区（次级运动区）有关（辅助运动区接受前额叶和基底神经节的大量纤维投射），如我们用手敲门。
不过内外部控制并不是被严格区分的，很多协调的动作是由多种来源的信息指导的。
内外源运动的区别，也体现在新手到专家的转变上。在刚学习一项运动时（新手），我们更多的依赖外界刺激做出动作调整，且往往是调整下一阶段的动作，此时，PET（正电子断层扫描）研究发现，外侧运动前区及前额叶区域的血流量发生了相应的变化；当我们熟练一项运动后，更多的是靠内源性信息指导，此时较少依赖外界的反馈（太过熟练了），更多的靠着自己内部加工来即时调整动作，在脑区中，辅助运动区和海马的血流量增加